Detecção molecular de rotavírus em suínos lactentes de criações comerciais no norte do Rio Grande do Sul

Abstract

O período neonatal é considerado um dos mais críticos na criação de animais de produção, sendo a diarreia uma importante causa de mortalidade em leitões lactentes. O rotavírus é considerado o principal agente etiológico viral envolvido em quadros de diarreia em recém nascidos, acometendo tanto humanos quanto animais de diferentes espécies, incluindo os suínos. A espécie mais frequentemente detectada é o rotavírus A (RVA), entretanto, os rotavírus B (RVB), C (RVC) e H (RVH) também já foram identificados em suínos no Brasil. Desta forma, o presente estudo teve como objetivo detectar a presença de RVA, RVB e RVC em amostras de fezes de leitões na fase de maternidade oriundas de sistemas intensivos de produção suinícola. Foram analisados 26 pools de fezes de leitões com 1 a 4 semanas de idade, provenientes de granjas comerciais localizadas na região norte do estado do Rio Grande do Sul. As coletas foram realizadas entre agosto e outubro de 2024, sendo cada pool composto por pelo menos 5 animais da mesma leitegada. A metodologia empregada envolveu a extração do material genético, seguida por protocolos de RT-PCR específicos para cada espécie de rotavírus, com posterior visualização dos produtos amplificados por meio de eletroforese em gel de agarose a 2%. Três amostras apresentaram resultado positivo na RT-PCR. Como perspectivas futuras, essas amostras serão submetidas ao sequenciamento genético pela técnica de Sanger e à análises filogenéticas, visando contribuir para a vigilância genômica e o monitoramento epidemiológico das variantes virais de rotavírus circulantes na suinocultura intensiva do Rio Grande do Sul.

The neonatal period is considered one of the most critical stages in livestock production, with diarrhea representing a major cause of mortality in suckling piglets. Rotavirus is recognized as the main viral etiological agent involved in neonatal diarrhea, affecting both humans and animals of various species, including swine. The most frequently detected species is rotavirus A (RVA), however, rotavirus B (RVB), C (RVC) and H (RVH) have also been identified in pigs in Brazil. Thus, the aim of this study was to detect the presence of RVA, RVB, and RVC in fecal samples from piglets in the farrowing phase, originating from intensive swine production systems. A total of 26 fecal pools from piglets aged 1 to 4 weeks collected from commercial farms located in the northern region of Rio Grande do Sul State were analyzed. Sample collection took place between August and October 2024, with each pool consisting of feces from at least five piglets from the same litter. The methodology involved the extraction of genetic material, followed by species-specific RT-PCR protocols for each rotavirus group, with subsequent visualization of the amplified products in 2% agarose gel electrophoresis. Three samples tested positive in RT-PCR. As future perspectives, these samples will be subjected to Sanger genetic sequencing and phylogenetic analysis, aiming to contribute to genomic surveillance and epidemiological monitoring of rotavirus circulating variants in intensive swine farms in Rio Grande do Sul.