Reconstrução filogenética e identificação das linhagens matrilinear do rebanho bubalino da Estação Experimental Agronômica da UFRGS

Abstract

A aquisição dos búfalos no Brasil inicialmente foi motivada pelo seu exotismo e não pelas suas qualidades zootécnicas. O maior interesse na espécie, particularmente após a década de 80, foi acompanhado de intenso intercâmbio de animais entre os estados brasileiros principalmente por criadores buscando introduzir espécimes de maior pureza racial e de características fenotípicas mais adequadas a seus objetivos de exploração. Essa mistura conferiu uma variabilidade que muitas vezes é observada na conformação corporal desses animais, caracterizando-se como uma variedade distinta. Algumas características exigidas no padrão racial são perdidas e estes indivíduos excluídos, diminuindo o número de animais disponíveis para seleção visando características de interesse econômico. Em casos como estes, a utilização da genética molecular pode ser um instrumento rápido para a identificação de animais que, se bem caracterizados, seriam mais interessantes para serem mantidos como reprodutores, aumentando a eficiência da seleção no gerenciamento dos rebanhos. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi realizar um diagnóstico de similaridade genética, a partir da construção de duas árvores filogenéticas, entre o rebanho de bubalinos da Estação Experimental Agronômica da UFRGS (EEA) e sequências obtidas no GenBank de indivíduos de diferentes espécies e raças bubalinas. Foi realizada extração do DNA total e reações em cadeia da polimerase (PCR) dos genes citocromo b (1.140 pb) e citocromo c oxidase I (631 pb), sendo posteriormente sequenciados. As filogenias foram reconstruídas utilizando 1.140 e 631 pares de bases dos genes mitocondriais citocromo b e citocromo c oxidase I respectivamente, e foram incluídas sequências de 14 diferentes espécies/raças de bubalinos obtidas no GenBank. Como resultado, em ambas as árvores os espécimes se agruparam com os indivíduos das raças Mediterrâneo, Murrah e Nili- Ravi. Isso representa um panorama de que a linhagem matrilinear do rebanho analisado, quando comparado com os indivíduos de diferentes raças e espécies de bubalinos, tem origem similar aos das raças Mediterrâneo, Murrah e Nili-Ravi.

The acquisition of buffaloes in Brazil was initially motivated by their exotic but not their zootechnical qualities. The interest in the species, mainly 1980s onwards, was accompanied by an intense exchange of animals between Brazilian states, mainly by breeders, seeking to introduce specimens with greater racial purity and phenotypic features more suited to their exploratory goals. This mixture provided a variability that is often observed in the body conformation of these animals, characterizing itself as a distinct variety. Some features required in the racial pattern are lost, and these individuals are excluded, reducing the number of animals available for selection aiming at features of economic interest. In these cases, molecular genetics can be a quick instrument to identify animals that, if well-characterized, would be more interesting to be kept as breeding animals, increasing the efficiency of selection in the herd's management. Thus, the goal of this study was to carry out a diagnosis of genetic similarity, from the construction of two phylogenetic trees, between the herd of buffaloes from the UFRGS Agronomic Experimental Station and sequences obtained from GenBank of buffaloes of different species and breeds. Phylogenies were reconstructed using 1.140 and 631 base pairs of mitochondrial cytochrome b and cytochrome c oxidase I genes. Sequences from 14 different species/breeds of associated buffaloes were included in GenBank. As a result, the specimens clustered with individuals of the Mediterranean, Murrah, and Nili-Ravi races in both trees. This represents a panorama in which the matrilineal lineage of the analyzed herd is similar to those of the Mediterranean, Murrah, and Nili-Ravi races, compared to individuals of different races and species of buffaloes.